在中国的广大乡村地区，基层治理是维护社会稳定和促进经济发展的重要基石。然而，随着社会的快速发展和城乡差距的扩大，农村基层治理面临着一系列挑战和难题。以下是当前中国农村基层治理中存在的一些主要问题和困境：

1. 基础设施建设滞后：许多偏远地区的农村基础设施仍然较为薄弱，道路、供水、供电等设施不完善，影响了村民的生活质量和生产效率。

2. 公共服务不足：教育、医疗、养老等基本公共服务的供给水平较低，难以满足农民日益增长的需求。尤其是在贫困山区或边远地区，这些服务可能完全缺失。

3. 环境污染与资源浪费：由于环保意识的缺乏和管理的不善，一些地方的农村出现了严重的环境污染现象，如水体污染、土壤退化、空气污染等，同时自然资源也存在着过度开发和浪费的问题。

4. 社会治理能力不强：部分村级组织的管理水平和治理能力不高，对于村务管理和矛盾纠纷处理的能力有限，导致了一些问题的积累和激化。

5. 经济发展的动力不足：虽然近年来政府加大了对农业的支持力度，但整体来看，农村经济的活力还不够强，产业单一且竞争力较弱，缺乏有效的市场机制和商业运作模式来推动可持续发展。

6. 人口老龄化和空心化：大量青壮年劳动力外出务工，导致了农村人口的老年化和村庄的空心化，这不仅影响到了农村的社会结构，也对家庭关系和社会和谐造成了冲击。

7. 文化传承与创新面临挑战：传统的农耕文化和乡土文明受到现代化的强烈冲击，如何在保护传统文化的同时实现创新发展，成为了一个重要的课题。

8. 政策执行不到位：尽管中央政府和各级地方政府出台了一系列扶持农村的政策措施，但在实际操作过程中，由于种种原因（如地方官员的执行力不够、信息传递不畅等），政策的落地效果往往打了折扣。

9. 法治建设有待加强：在一些地方，法律意识淡薄，违法行为时有发生，而依法办事的环境尚未完全形成，这对农村的长治久安构成了威胁。

为了解决这些问题，国家已经采取了一系列措施，包括加大对农村基础设施建设的投入、推进公共服务均等化、强化环境保护和资源节约、提高社会治理能力和效能、鼓励和支持农村产业发展、吸引年轻人回乡创业就业以及加强文化建设和法治宣传等。然而，这些工作的实施还需要更多的资源和时间，同时也需要社会各界共同努力，共同推动农村基层治理水平的提升。